南通市中医院始建于1956年，首任院长为首届“国医大师”朱良春。医院是首批“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”之一、南京中医药大学南通附属医院。医院现设2个院区，建设路院区和孩儿巷院区，床位1200张。医院现有职工1465人，具有高级职称者416人，硕博士357人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师3人，国务院特贴专家8人，江苏省名中医8人，江苏省老中医药专家学术经验继承工作指导老师4人，南通市名中医27人。建院以来，先后荣获科研成果奖近150项，其中“季德胜蛇药片”“拔核疗法治疗瘰病”“新药金荞麦”为国家级成果。